Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLEC4DQ8WXI8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLEC4DQ8WXI8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLEC4DQ8WXI8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLEC4DQ8WXI8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLEC4DQ8WXI8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLEC4DQ8WXI8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLEC4DQ8WXI8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLEC4DQ8WXI8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLEC4DQ8WXI8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms