Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWIST2Q8WVJ9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TWIST2Q8WVJ9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWIST2Q8WVJ9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWIST2Q8WVJ9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TWIST2Q8WVJ9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TWIST2Q8WVJ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TWIST2Q8WVJ9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWIST2Q8WVJ9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWIST2Q8WVJ9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWIST2Q8WVJ9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWIST2Q8WVJ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWIST2Q8WVJ9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWIST2Q8WVJ9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TWIST2Q8WVJ9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWIST2Q8WVJ9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TWIST2Q8WVJ9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWIST2Q8WVJ9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWIST2Q8WVJ9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TWIST2Q8WVJ9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWIST2Q8WVJ9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TWIST2Q8WVJ9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms