Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC107Q8WV48 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC107Q8WV48 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC107Q8WV48 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC107Q8WV48 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC107Q8WV48 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC107Q8WV48 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC107Q8WV48 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC107Q8WV48 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC107Q8WV48 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC107Q8WV48 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC107Q8WV48 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC107Q8WV48 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC107Q8WV48 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC107Q8WV48 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC107Q8WV48 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC107Q8WV48 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC107Q8WV48 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC107Q8WV48 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms