Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
COL22A1Q8NFW1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
COL22A1Q8NFW1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
COL22A1Q8NFW1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
COL22A1Q8NFW1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
COL22A1Q8NFW1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
COL22A1Q8NFW1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
COL22A1Q8NFW1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
COL22A1Q8NFW1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
COL22A1Q8NFW1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
COL22A1Q8NFW1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
COL22A1Q8NFW1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
COL22A1Q8NFW1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
COL22A1Q8NFW1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
COL22A1Q8NFW1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
COL22A1Q8NFW1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
COL22A1Q8NFW1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
COL22A1Q8NFW1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
COL22A1Q8NFW1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
COL22A1Q8NFW1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
COL22A1Q8NFW1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
COL22A1Q8NFW1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
COL22A1Q8NFW1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
COL22A1Q8NFW1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
COL22A1Q8NFW1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
COL22A1Q8NFW1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
COL22A1Q8NFW1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
COL22A1Q8NFW1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
COL22A1Q8NFW1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
COL22A1Q8NFW1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
COL22A1Q8NFW1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
COL22A1Q8NFW1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
COL22A1Q8NFW1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
COL22A1Q8NFW1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
COL22A1Q8NFW1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
COL22A1Q8NFW1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
COL22A1Q8NFW1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.39■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
COL22A1Q8NFW1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
COL22A1Q8NFW1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms