Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NECAB1Q8N987 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NECAB1Q8N987 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NECAB1Q8N987 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NECAB1Q8N987 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NECAB1Q8N987 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NECAB1Q8N987 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NECAB1Q8N987 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NECAB1Q8N987 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NECAB1Q8N987 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NECAB1Q8N987 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NECAB1Q8N987 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NECAB1Q8N987 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NECAB1Q8N987 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NECAB1Q8N987 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NECAB1Q8N987 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NECAB1Q8N987 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NECAB1Q8N987 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NECAB1Q8N987 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NECAB1Q8N987 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NECAB1Q8N987 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NECAB1Q8N987 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NECAB1Q8N987 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NECAB1Q8N987 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NECAB1Q8N987 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NECAB1Q8N987 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NECAB1Q8N987 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NECAB1Q8N987 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NECAB1Q8N987 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.4 ms