Protein–RNA interactions for Protein: Q8N535

LINC00471, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00471, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00471Q8N535 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00471Q8N535 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00471Q8N535 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00471Q8N535 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms