Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHERPQ8IWX8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHERPQ8IWX8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHERPQ8IWX8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHERPQ8IWX8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms