Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFTPA2Q8IWL1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFTPA2Q8IWL1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SFTPA2Q8IWL1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms