Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4I7

LIMS2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2Q7Z4I7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIMS2Q7Z4I7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIMS2Q7Z4I7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIMS2Q7Z4I7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LIMS2Q7Z4I7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIMS2Q7Z4I7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIMS2Q7Z4I7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIMS2Q7Z4I7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LIMS2Q7Z4I7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LIMS2Q7Z4I7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIMS2Q7Z4I7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms