Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KRT28Q7Z3Y7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KRT28Q7Z3Y7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KRT28Q7Z3Y7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
KRT28Q7Z3Y7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KRT28Q7Z3Y7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KRT28Q7Z3Y7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KRT28Q7Z3Y7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
KRT28Q7Z3Y7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
KRT28Q7Z3Y7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
KRT28Q7Z3Y7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
KRT28Q7Z3Y7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KRT28Q7Z3Y7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KRT28Q7Z3Y7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KRT28Q7Z3Y7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KRT28Q7Z3Y7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KRT28Q7Z3Y7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
KRT28Q7Z3Y7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms