Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZD4Q76G19 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZD4Q76G19 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZD4Q76G19 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZD4Q76G19 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms