Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
BRINP3Q76B58 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
BRINP3Q76B58 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
BRINP3Q76B58 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
BRINP3Q76B58 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
BRINP3Q76B58 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BRINP3Q76B58 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BRINP3Q76B58 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
BRINP3Q76B58 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
BRINP3Q76B58 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
BRINP3Q76B58 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BRINP3Q76B58 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
BRINP3Q76B58 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
BRINP3Q76B58 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
BRINP3Q76B58 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
BRINP3Q76B58 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
BRINP3Q76B58 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
BRINP3Q76B58 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
BRINP3Q76B58 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
BRINP3Q76B58 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms