Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H2AFVQ71UI9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H2AFVQ71UI9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2AFVQ71UI9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H2AFVQ71UI9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms