Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP30Q70CQ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP30Q70CQ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP30Q70CQ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms