Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN12Q6ZSI9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN12Q6ZSI9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN12Q6ZSI9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN12Q6ZSI9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms