Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CCDC141Q6ZP82 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CCDC141Q6ZP82 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CCDC141Q6ZP82 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC141Q6ZP82 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC141Q6ZP82 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC141Q6ZP82 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC141Q6ZP82 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CCDC141Q6ZP82 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC141Q6ZP82 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC141Q6ZP82 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC141Q6ZP82 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CCDC141Q6ZP82 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CCDC141Q6ZP82 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CCDC141Q6ZP82 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CCDC141Q6ZP82 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CCDC141Q6ZP82 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CCDC141Q6ZP82 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CCDC141Q6ZP82 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CCDC141Q6ZP82 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CCDC141Q6ZP82 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CCDC141Q6ZP82 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
CCDC141Q6ZP82 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms