Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRSAM1Q6UWE0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRSAM1Q6UWE0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LRSAM1Q6UWE0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRSAM1Q6UWE0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms