Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIZ9

TRAT1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAT1Q6PIZ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAT1Q6PIZ9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAT1Q6PIZ9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAT1Q6PIZ9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms