Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNNM4Q6P4Q7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNNM4Q6P4Q7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNNM4Q6P4Q7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms