Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TTC41PQ6P2S7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TTC41PQ6P2S7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TTC41PQ6P2S7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TTC41PQ6P2S7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TTC41PQ6P2S7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TTC41PQ6P2S7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TTC41PQ6P2S7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
TTC41PQ6P2S7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
TTC41PQ6P2S7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TTC41PQ6P2S7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTC41PQ6P2S7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms