Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LETMD1Q6P1Q0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LETMD1Q6P1Q0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LETMD1Q6P1Q0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LETMD1Q6P1Q0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms