Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K2

PMF1, Polyamine-modulated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1Q6P1K2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PMF1Q6P1K2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PMF1Q6P1K2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PMF1Q6P1K2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PMF1Q6P1K2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PMF1Q6P1K2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PMF1Q6P1K2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PMF1Q6P1K2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PMF1Q6P1K2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PMF1Q6P1K2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PMF1Q6P1K2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PMF1Q6P1K2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PMF1Q6P1K2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PMF1Q6P1K2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PMF1Q6P1K2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms