Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXM1

CDCP2, CUB domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCP2Q5VXM1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCP2Q5VXM1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDCP2Q5VXM1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDCP2Q5VXM1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCP2Q5VXM1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCP2Q5VXM1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDCP2Q5VXM1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.4 ms