Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD13Q5VXD3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD13Q5VXD3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD13Q5VXD3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms