Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1QL3Q5VWW1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QL3Q5VWW1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QL3Q5VWW1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms