Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C12orf60Q5U649 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C12orf60Q5U649 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C12orf60Q5U649 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C12orf60Q5U649 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C12orf60Q5U649 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C12orf60Q5U649 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C12orf60Q5U649 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C12orf60Q5U649 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C12orf60Q5U649 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C12orf60Q5U649 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C12orf60Q5U649 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C12orf60Q5U649 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
C12orf60Q5U649 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C12orf60Q5U649 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C12orf60Q5U649 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C12orf60Q5U649 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C12orf60Q5U649 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C12orf60Q5U649 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
C12orf60Q5U649 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
C12orf60Q5U649 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C12orf60Q5U649 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
C12orf60Q5U649 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C12orf60Q5U649 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C12orf60Q5U649 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C12orf60Q5U649 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C12orf60Q5U649 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C12orf60Q5U649 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C12orf60Q5U649 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C12orf60Q5U649 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
C12orf60Q5U649 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
C12orf60Q5U649 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C12orf60Q5U649 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C12orf60Q5U649 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C12orf60Q5U649 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
C12orf60Q5U649 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
C12orf60Q5U649 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
C12orf60Q5U649 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C12orf60Q5U649 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms