Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HDGFL1Q5TGJ6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HDGFL1Q5TGJ6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HDGFL1Q5TGJ6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HDGFL1Q5TGJ6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HDGFL1Q5TGJ6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HDGFL1Q5TGJ6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HDGFL1Q5TGJ6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HDGFL1Q5TGJ6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HDGFL1Q5TGJ6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HDGFL1Q5TGJ6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HDGFL1Q5TGJ6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HDGFL1Q5TGJ6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HDGFL1Q5TGJ6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HDGFL1Q5TGJ6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HDGFL1Q5TGJ6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HDGFL1Q5TGJ6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
HDGFL1Q5TGJ6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HDGFL1Q5TGJ6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
HDGFL1Q5TGJ6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
HDGFL1Q5TGJ6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms