Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LGSNQ5TDP6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGSNQ5TDP6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGSNQ5TDP6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms