Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00242Q5T6M2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms