Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4J0

GCNT6, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 6, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT6Q5T4J0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT6Q5T4J0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT6Q5T4J0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT6Q5T4J0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT6Q5T4J0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT6Q5T4J0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT6Q5T4J0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT6Q5T4J0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT6Q5T4J0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT6Q5T4J0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT6Q5T4J0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT6Q5T4J0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT6Q5T4J0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT6Q5T4J0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT6Q5T4J0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT6Q5T4J0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT6Q5T4J0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT6Q5T4J0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCNT6Q5T4J0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT6Q5T4J0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT6Q5T4J0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT6Q5T4J0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT6Q5T4J0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT6Q5T4J0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT6Q5T4J0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT6Q5T4J0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms