Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
FRMPD1Q5SYB0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
FRMPD1Q5SYB0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
FRMPD1Q5SYB0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
FRMPD1Q5SYB0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
FRMPD1Q5SYB0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
FRMPD1Q5SYB0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
FRMPD1Q5SYB0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
FRMPD1Q5SYB0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
FRMPD1Q5SYB0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
FRMPD1Q5SYB0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
FRMPD1Q5SYB0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
FRMPD1Q5SYB0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
FRMPD1Q5SYB0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
FRMPD1Q5SYB0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
FRMPD1Q5SYB0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
FRMPD1Q5SYB0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
FRMPD1Q5SYB0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
FRMPD1Q5SYB0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
FRMPD1Q5SYB0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
FRMPD1Q5SYB0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
FRMPD1Q5SYB0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
FRMPD1Q5SYB0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
FRMPD1Q5SYB0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
FRMPD1Q5SYB0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
FRMPD1Q5SYB0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
FRMPD1Q5SYB0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
FRMPD1Q5SYB0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
FRMPD1Q5SYB0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
FRMPD1Q5SYB0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
FRMPD1Q5SYB0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
FRMPD1Q5SYB0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
FRMPD1Q5SYB0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
FRMPD1Q5SYB0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
FRMPD1Q5SYB0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
FRMPD1Q5SYB0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
FRMPD1Q5SYB0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.28■■■■□ 3.56
FRMPD1Q5SYB0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
FRMPD1Q5SYB0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
FRMPD1Q5SYB0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
FRMPD1Q5SYB0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
FRMPD1Q5SYB0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
FRMPD1Q5SYB0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms