Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
SNAPC4Q5SXM2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC40.85■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.85■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
SNAPC4Q5SXM2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
SNAPC4Q5SXM2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC40.82■■■■■ 4.12
SNAPC4Q5SXM2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
SNAPC4Q5SXM2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
SNAPC4Q5SXM2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SNAPC4Q5SXM2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SNAPC4Q5SXM2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
SNAPC4Q5SXM2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
SNAPC4Q5SXM2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
SNAPC4Q5SXM2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
SNAPC4Q5SXM2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
SNAPC4Q5SXM2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
SNAPC4Q5SXM2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
SNAPC4Q5SXM2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
SNAPC4Q5SXM2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
SNAPC4Q5SXM2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
SNAPC4Q5SXM2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
SNAPC4Q5SXM2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
SNAPC4Q5SXM2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.75■■■■■ 4.11
SNAPC4Q5SXM2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
SNAPC4Q5SXM2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
SNAPC4Q5SXM2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC40.74■■■■■ 4.11
SNAPC4Q5SXM2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
SNAPC4Q5SXM2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
SNAPC4Q5SXM2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
SNAPC4Q5SXM2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
SNAPC4Q5SXM2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
SNAPC4Q5SXM2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC40.63■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC40.63■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
SNAPC4Q5SXM2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
SNAPC4Q5SXM2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SNAPC4Q5SXM2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
SNAPC4Q5SXM2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
SNAPC4Q5SXM2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SNAPC4Q5SXM2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
SNAPC4Q5SXM2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SNAPC4Q5SXM2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
SNAPC4Q5SXM2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
SNAPC4Q5SXM2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
SNAPC4Q5SXM2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
SNAPC4Q5SXM2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
SNAPC4Q5SXM2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
SNAPC4Q5SXM2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
SNAPC4Q5SXM2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
SNAPC4Q5SXM2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
SNAPC4Q5SXM2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
SNAPC4Q5SXM2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
SNAPC4Q5SXM2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms