Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFT2D3Q587I9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFT2D3Q587I9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms