Protein–RNA interactions for Protein: Q52LC2

ATP6AP1L, V-type proton ATPase subunit S1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1LQ52LC2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP6AP1LQ52LC2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6AP1LQ52LC2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP6AP1LQ52LC2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP6AP1LQ52LC2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP6AP1LQ52LC2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP6AP1LQ52LC2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP6AP1LQ52LC2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP6AP1LQ52LC2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6AP1LQ52LC2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6AP1LQ52LC2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6AP1LQ52LC2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6AP1LQ52LC2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6AP1LQ52LC2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6AP1LQ52LC2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6AP1LQ52LC2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6AP1LQ52LC2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6AP1LQ52LC2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6AP1LQ52LC2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6AP1LQ52LC2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms