Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT71Q3SY84 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT71Q3SY84 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT71Q3SY84 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms