Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C18orf21Q32NC0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C18orf21Q32NC0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C18orf21Q32NC0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C18orf21Q32NC0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C18orf21Q32NC0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C18orf21Q32NC0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C18orf21Q32NC0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C18orf21Q32NC0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C18orf21Q32NC0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C18orf21Q32NC0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C18orf21Q32NC0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C18orf21Q32NC0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C18orf21Q32NC0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C18orf21Q32NC0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C18orf21Q32NC0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C18orf21Q32NC0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C18orf21Q32NC0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms