Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
FHOD3Q2V2M9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
FHOD3Q2V2M9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
FHOD3Q2V2M9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
FHOD3Q2V2M9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
FHOD3Q2V2M9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
FHOD3Q2V2M9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
FHOD3Q2V2M9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
FHOD3Q2V2M9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
FHOD3Q2V2M9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
FHOD3Q2V2M9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
FHOD3Q2V2M9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
FHOD3Q2V2M9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
FHOD3Q2V2M9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
FHOD3Q2V2M9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
FHOD3Q2V2M9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
FHOD3Q2V2M9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
FHOD3Q2V2M9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
FHOD3Q2V2M9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
FHOD3Q2V2M9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
FHOD3Q2V2M9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
FHOD3Q2V2M9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
FHOD3Q2V2M9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
FHOD3Q2V2M9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
FHOD3Q2V2M9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
FHOD3Q2V2M9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
FHOD3Q2V2M9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
FHOD3Q2V2M9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
FHOD3Q2V2M9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
FHOD3Q2V2M9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
FHOD3Q2V2M9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
FHOD3Q2V2M9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC39■■■■□ 3.83
FHOD3Q2V2M9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
FHOD3Q2V2M9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC39■■■■□ 3.83
FHOD3Q2V2M9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC39■■■■□ 3.83
FHOD3Q2V2M9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
FHOD3Q2V2M9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
FHOD3Q2V2M9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
FHOD3Q2V2M9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
FHOD3Q2V2M9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.98■■■■□ 3.83
FHOD3Q2V2M9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
FHOD3Q2V2M9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
FHOD3Q2V2M9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
FHOD3Q2V2M9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
FHOD3Q2V2M9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
FHOD3Q2V2M9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
FHOD3Q2V2M9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
FHOD3Q2V2M9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
FHOD3Q2V2M9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
FHOD3Q2V2M9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC38.86■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
FHOD3Q2V2M9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms