Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK2Q16620 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTRK2Q16620 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK2Q16620 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
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