Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CRY1Q16526 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRY1Q16526 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRY1Q16526 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRY1Q16526 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms