Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC6Q16204 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC6Q16204 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC6Q16204 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
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