Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HERC1Q15751 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HERC1Q15751 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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