Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL19A1Q14993 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL19A1Q14993 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
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COL19A1Q14993 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
COL19A1Q14993 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL19A1Q14993 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
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