Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE6HQ13956 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE6HQ13956 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE6HQ13956 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE6HQ13956 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE6HQ13956 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE6HQ13956 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE6HQ13956 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE6HQ13956 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE6HQ13956 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE6HQ13956 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDE6HQ13956 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDE6HQ13956 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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