Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRF5Q13568 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRF5Q13568 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRF5Q13568 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRF5Q13568 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRF5Q13568 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IRF5Q13568 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRF5Q13568 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRF5Q13568 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
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