Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MADCAM1Q13477 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MADCAM1Q13477 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MADCAM1Q13477 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MADCAM1Q13477 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MADCAM1Q13477 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MADCAM1Q13477 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MADCAM1Q13477 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MADCAM1Q13477 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MADCAM1Q13477 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MADCAM1Q13477 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MADCAM1Q13477 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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