Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHAF1AQ13111 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CHAF1AQ13111 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CHAF1AQ13111 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHAF1AQ13111 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
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