Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRJQ12913 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRJQ12913 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRJQ12913 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
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