Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SLFN5Q08AF3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SLFN5Q08AF3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SLFN5Q08AF3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SLFN5Q08AF3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms