Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GABPAQ06546 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GABPAQ06546 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GABPAQ06546 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GABPAQ06546 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms