Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TLE4Q04727 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TLE4Q04727 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLE4Q04727 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TLE4Q04727 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLE4Q04727 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TLE4Q04727 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TLE4Q04727 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms